Protein–RNA interactions for Protein: P63208

SKP1, S-phase kinase-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 163 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP1P63208 TDRD5-201ENST00000294848 3525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 GORASP2-201ENST00000234160 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 USP31-203ENST00000567975 2142 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 NLRC3-202ENST00000359128 6401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SKP1P63208 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CFAP157-206ENST00000614677 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 DFFA-202ENST00000377038 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 LINC002481-201ENST00000499502 1821 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 RAPGEF1-201ENST00000372189 6085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 TDP2-201ENST00000341060 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AL139420.2-201ENST00000449439 410 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SIGLEC18P-201ENST00000602271 909 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 REXO1L1P-201ENST00000379010 6598 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AMER3-202ENST00000423981 6172 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 DNMT3B-202ENST00000328111 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 FAM86C1-201ENST00000346333 2010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CFAP65-208ENST00000453220 5877 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ABI2-202ENST00000261017 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PAAF1-201ENST00000310571 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SPTBN2-201ENST00000309996 7866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ATG14-201ENST00000247178 4742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SHROOM1-208ENST00000617339 3638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SPOUT1-201ENST00000361256 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 SH3PXD2A-203ENST00000369774 11468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 PPDPF-202ENST00000370179 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
SKP1P63208 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms