Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC092638.2-201ENST00000441105 947 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RN7SL564P-201ENST00000496309 250 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC006064.4-201ENST00000602946 422 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BCL2L13-206ENST00000399782 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SCAF4-202ENST00000399804 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RNASE7-201ENST00000298690 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SEC13-203ENST00000383801 1479 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PRUNE1-205ENST00000368937 1850 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LILRB2-202ENST00000391746 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CDYL2-203ENST00000562812 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ABCF3-201ENST00000292808 2453 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PSEN2-201ENST00000366782 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KCNN2-206ENST00000512097 3076 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LIMD1-202ENST00000440097 2773 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PAG1-201ENST00000220597 10744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RERG-204ENST00000536465 2134 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DHX16-201ENST00000376437 1933 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MKL1-212ENST00000618417 1842 ntTSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NT5DC4-201ENST00000327581 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC7.9□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL355102.3-201ENST00000554299 1678 ntBASIC7.9□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms