Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PGAP2-202ENST00000300730 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 DCAF8-201ENST00000326837 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RS1-201ENST00000379984 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GGA3-214ENST00000582717 2255 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SUGP2-215ENST00000601879 5546 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RHPN1-AS1-201ENST00000518049 1918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CEP131-201ENST00000269392 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PSKH1-201ENST00000291041 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FAM120B-205ENST00000630384 3721 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TBX6-202ENST00000395224 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 KIAA1683-201ENST00000392413 4402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GNAI2-207ENST00000451956 1486 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GAB2-202ENST00000361507 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TMEM100-201ENST00000424486 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 UROS-203ENST00000368786 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 DBNDD1-206ENST00000568838 993 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RBM15-203ENST00000602849 3368 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ADRA2B-201ENST00000620793 3371 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PCDHB10-201ENST00000239446 3290 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GOLGA2P5-201ENST00000266746 2395 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SERBP1-204ENST00000370995 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 LPO-203ENST00000421678 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 SUN2-201ENST00000405018 4022 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FAM187A-201ENST00000331733 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 CCDC103-204ENST00000417826 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AC244197.3-201ENST00000422081 2635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 AL022323.5-201ENST00000624101 2059 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 ABCB7-203ENST00000373394 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
GGCXP38435 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms