Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LANCL3-202ENST00000378621 10298 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 DERL3-202ENST00000318109 860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ZNRD1-203ENST00000376782 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC024293.1-201ENST00000467930 498 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 NT5C-204ENST00000578337 582 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SCARB2-215ENST00000639145 4471 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LIPA-205ENST00000456827 2527 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ANXA5-202ENST00000501272 1363 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CHI3L1-201ENST00000255409 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 HPSE2-206ENST00000628193 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 RIC1-203ENST00000414202 6774 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SEC61B-201ENST00000223641 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 TMEM14C-201ENST00000229563 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 KRT18P66-201ENST00000452970 1269 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ZSCAN2-208ENST00000485222 910 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SEC61B-203ENST00000498603 587 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ZSCAN2-210ENST00000538076 1109 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 DKKL1-202ENST00000594268 524 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AC011247.3-201ENST00000603297 438 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 GOLGA8UP-201ENST00000527159 1755 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 WNT2B-202ENST00000369684 3818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 AL365181.1-201ENST00000564032 1828 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OTX2P32243 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.1 ms