Protein–RNA interactions for Protein: P16422

EPCAM, Epithelial cell adhesion molecule, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPCAMP16422 AC133141.1-201ENST00000443015 339 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AP003351.1-201ENST00000522743 668 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SRP14-208ENST00000560773 468 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC004686.1-201ENST00000605113 538 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC01726-201ENST00000624692 1253 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DNAJC10-211ENST00000640034 888 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RCC2P1-201ENST00000452257 1476 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CLUL1-202ENST00000400606 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CNBP-203ENST00000446936 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CNBP-204ENST00000451728 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 TMTC1-207ENST00000552618 3915 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 VPS28-201ENST00000292510 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CALML6-201ENST00000307786 1101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 VPS28-202ENST00000377348 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 SNORA57-201ENST00000383870 149 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 KRTAP2-3-201ENST00000391418 875 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MPV17-207ENST00000403262 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PGK1P2-201ENST00000431702 1214 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 HDAC2-AS2-203ENST00000436876 591 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 KRT19P4-201ENST00000443208 943 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC112250.1-201ENST00000504640 745 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 VPS28-210ENST00000529182 1010 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FAM192A-218ENST00000567439 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PRMT1P1-201ENST00000604252 1009 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FRZB-201ENST00000295113 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 DNAJB6-204ENST00000429029 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 MSMO1-201ENST00000261507 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
EPCAMP16422 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms