Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SEMA6D-206ENST00000389428 5874 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZMYND10-201ENST00000231749 2896 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SPAG5-AS1-201ENST00000414744 2143 ntTSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ITGA3-201ENST00000007722 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PCDHB19P-202ENST00000625133 2914 ntBASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RNF43-202ENST00000577625 2198 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL133387.2-201ENST00000422661 2222 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CDC6-201ENST00000209728 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SPATS2-201ENST00000321898 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ENOX2-204ENST00000394363 4174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MYH11-202ENST00000396324 6847 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKN-205ENST00000366897 2877 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GNPNAT1-201ENST00000216410 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NOL4L-203ENST00000359676 5991 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TNF-208ENST00000449264 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NXPE3-205ENST00000491511 8074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PHF13-201ENST00000377648 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO1C-202ENST00000361007 4734 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 LINC00343-203ENST00000454555 1765 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KCNH1-209ENST00000639952 8075 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SYK-204ENST00000375754 5005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 GTF2IRD1P1-202ENST00000457166 2426 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 NCSTN-202ENST00000368063 3031 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 FAM86JP-201ENST00000467239 1910 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ATAD2-201ENST00000287394 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ATAT1-206ENST00000376485 1476 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ASB2-201ENST00000315988 2743 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 RPL27A-201ENST00000314138 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 BCL2L2-201ENST00000250405 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC022364.1-202ENST00000617468 2409 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 OGFR-202ENST00000370461 4506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 SIRPA-204ENST00000622179 4570 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ALDH7A1-234ENST00000637782 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC9-201ENST00000254037 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM136-202ENST00000375095 4143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 STX16-NPEPL1-202ENST00000530122 3433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 CNKSR2-207ENST00000543067 4355 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ARL2-SNX15V9GYD0 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms