Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 GYG1-209ENST00000483267 801 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 WNT5A-205ENST00000497027 1299 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TIMM10-202ENST00000525158 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AP000920.1-201ENST00000531824 344 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AP003071.1-201ENST00000567925 622 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RN7SL480P-201ENST00000581481 294 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC011489.1-201ENST00000586744 690 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 USE1-207ENST00000596136 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 HAMP-203ENST00000598398 652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 FAM230C-201ENST00000623511 1970 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PRKAB1-201ENST00000229328 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CNGB1-202ENST00000311183 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 KRT18P44-201ENST00000416086 1285 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC004522.1-201ENST00000419978 654 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PLA2G1B-202ENST00000423423 423 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC004923.3-201ENST00000527532 355 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PIGCP1-201ENST00000527583 895 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NPAS3-209ENST00000551008 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SMIM26-203ENST00000608034 670 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL606763.1-201ENST00000629535 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 IQSEC2-207ENST00000638583 722 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC00205-201ENST00000433465 1391 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PSMC5-212ENST00000581882 1474 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PODN-207ENST00000618387 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 KRT36-202ENST00000393986 1707 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC099548.2-204ENST00000481651 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 FAM189A2-202ENST00000303068 2051 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC01658-201ENST00000320372 1578 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DMC1-207ENST00000616615 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SLC25A5-201ENST00000317881 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC027612.2-201ENST00000436174 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RN7SL523P-201ENST00000484401 298 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SELENOW-202ENST00000593892 550 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC245595.2-201ENST00000620141 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
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