Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SAMD4A-213ENST00000631086 6677 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC011298.1-201ENST00000407635 3398 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SLC35G1-201ENST00000371408 3490 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CASKIN2-202ENST00000433559 3950 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PRIMA1-201ENST00000316227 1080 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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PPARGC1AQ9UBK2 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PPARGC1AQ9UBK2 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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PPARGC1AQ9UBK2 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PCGF2-203ENST00000616129 1534 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 PCTP-207ENST00000576183 2680 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ISY1-RAB43-201ENST00000418265 4868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
PPARGC1AQ9UBK2 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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