Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2N2

ARHGAP28, Rho GTPase-activating protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 729 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL375P-201ENST00000492442 298 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SKP155-201ENST00000516031 288 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AIPL1-211ENST00000576776 1190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02135-201ENST00000599486 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 BATF-202ENST00000555504 361 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 HELLS-212ENST00000630929 400 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ARHGAP28Q9P2N2 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 PRKACB-205ENST00000370688 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CPPED1-201ENST00000261660 1898 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 SLC43A3-214ENST00000529554 2207 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TCOF1-202ENST00000377797 5095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FAM213A-204ENST00000372188 829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 RNA5SP406-201ENST00000516106 112 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ARHGAP28Q9P2N2 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms