Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GPC3P51654 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TXNDC9-201ENST00000264255 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC004890.2-205ENST00000416232 2804 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZBP1-201ENST00000371173 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FZD5-201ENST00000295417 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 APBB3-205ENST00000412920 1455 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AOC1-201ENST00000360937 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC132825.4-202ENST00000578792 434 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AC009084.3-201ENST00000623356 437 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PLLP-205ENST00000613167 7578 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 RPL18A-205ENST00000600147 1391 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MED4-201ENST00000258648 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MAP3K3-203ENST00000577395 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TPM2-204ENST00000378300 1771 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GPC3P51654 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PPP1R1B-203ENST00000394267 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 MSI1-201ENST00000257552 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SAR1A-204ENST00000373241 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GPC3P51654 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 252.9 ms