Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SYT17-208ENST00000568433 812 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 HDDC2-204ENST00000608295 879 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TMEM130-203ENST00000416379 2881 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AP3M2-207ENST00000518421 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC067931.2-201ENST00000623655 2003 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ACSM2A-209ENST00000573854 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SNCAIP-222ENST00000542191 2729 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SYK-203ENST00000375751 4936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 FAM189A1-201ENST00000261275 4705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 NUP62CL-201ENST00000372466 1755 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC093797.1-201ENST00000411847 1789 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SLC4A7-207ENST00000437179 3667 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 IZUMO1-201ENST00000332955 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CCDC138-203ENST00000412964 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC12.48□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SHC1-202ENST00000368445 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 PWWP2A-202ENST00000456329 3991 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ACTG1-206ENST00000573283 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 KRT17P4-205ENST00000579946 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 RAPH1-202ENST00000319170 9808 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SARS-202ENST00000369923 1882 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 MFAP3-202ENST00000439768 1186 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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CTLA4P16410 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
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CTLA4P16410 TMEM87B-201ENST00000283206 5212 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
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CTLA4P16410 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 HEPACAM-201ENST00000298251 3602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 HSPH1-202ENST00000380405 3480 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 MAP7-202ENST00000432797 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 NEK4-207ENST00000535191 2452 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 ZNF541-202ENST00000314121 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 MAP7-205ENST00000544465 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 JUN-201ENST00000371222 3540 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 SLC20A2-207ENST00000520179 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 CCNG2-202ENST00000395640 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTLA4P16410 TP73-207ENST00000378290 1831 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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