Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 GOLGA8F-202ENST00000532622 2009 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RANGRF-201ENST00000226105 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 VPREB3-201ENST00000248948 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FAM178B-201ENST00000393526 1004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 VPREB3-202ENST00000398465 503 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AP000553.2-201ENST00000609038 441 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 LINC00969-321ENST00000629990 806 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 IP6K2-211ENST00000432678 1309 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TBC1D3-201ENST00000620215 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TBC1D3C-201ENST00000622206 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 EDF1-201ENST00000224073 640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 BLVRA-201ENST00000265523 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PAEP-201ENST00000277508 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 DUX4L31-201ENST00000446466 1136 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TULP3P1-202ENST00000453253 1291 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 EFNA5-204ENST00000509503 637 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CCNL2P1-201ENST00000512846 969 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RPL10P8-201ENST00000522888 313 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC010319.2-201ENST00000594663 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AL109954.3-201ENST00000615088 558 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PCP2-201ENST00000311069 776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TPM3-204ENST00000323144 1088 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ASLP1-201ENST00000428790 637 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 RPL3P9-201ENST00000463217 1183 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AL358215.1-201ENST00000481350 482 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CXXC1P1-202ENST00000489409 1212 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 IMMP1L-215ENST00000534812 612 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC140912.1-202ENST00000561802 194 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 GMFG-206ENST00000597595 758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC148476.1-201ENST00000622182 705 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 AC139795.2-201ENST00000499900 1751 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 MEG8-221ENST00000636391 2155 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CCER1-201ENST00000358859 2962 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 DDC-212ENST00000615193 1674 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 LXN-201ENST00000264265 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 KRTAP12-1-201ENST00000391617 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 NOS2P3-201ENST00000411468 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
C4BP0C0L5 NOS2P2-201ENST00000426269 867 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
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