Protein–RNA interactions for Protein: P08151

GLI1, Zinc finger protein GLI1, humanhuman

Predictions only

Length 1,106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI1P08151 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 PBXIP1-203ENST00000368465 3144 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 PTPN5-205ENST00000477854 2826 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 PLAT-201ENST00000220809 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 AP1B1-201ENST00000317368 3903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 PRAME-202ENST00000398743 2196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 LRRC17-201ENST00000249377 2002 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 ZNF384-201ENST00000319770 3266 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
GLI1P08151 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 TFR2-205ENST00000462107 3131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 CLCN7-203ENST00000448525 4151 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 CAMSAP3-201ENST00000160298 3889 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SAP30BP-202ENST00000355423 2439 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 PDHA1-212ENST00000540249 3277 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 INSC-207ENST00000528567 2237 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 FUNDC2P2-201ENST00000331369 1223 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 PGAM1P5-202ENST00000552554 2148 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 YY1AP1-208ENST00000361831 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SREBF1-202ENST00000355815 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SFI1-208ENST00000432498 4162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 KAT7-204ENST00000454930 1774 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 OTUD4-201ENST00000447906 3829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 IFT81-202ENST00000361948 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 ACO1-203ENST00000541043 3618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 KRT33B-201ENST00000251646 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
GLI1P08151 SECISBP2-202ENST00000375807 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 AC009474.1-201ENST00000455096 1565 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 MEST-206ENST00000416162 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 HINT3-201ENST00000229633 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 PLAT-203ENST00000429089 2599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 PTCHD3-201ENST00000438700 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 EIF3CL-201ENST00000380876 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 CICP1-201ENST00000416803 2410 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 FAM201A-201ENST00000377680 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 SSBP2-220ENST00000615665 4465 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
GLI1P08151 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms