Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 HRC-201ENST00000252825 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DPP8-201ENST00000300141 3139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TRAPPC9-201ENST00000389328 4474 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL358334.2-201ENST00000553648 4714 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SRGAP3-201ENST00000360413 8415 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LRRC8A-203ENST00000372600 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LDLRAD4-AS1-201ENST00000588672 2190 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IKBKB-218ENST00000520835 2403 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RASA4CP-203ENST00000446874 3193 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RGS12-201ENST00000336727 4674 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KIF17-202ENST00000375044 3572 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RAP2B-201ENST00000323534 8351 ntAPPRIS P1 BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KIAA1191-202ENST00000393725 2700 ntTSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.54□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 DSCAML1-203ENST00000527706 6099 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SNX25-201ENST00000264694 3264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC16A2-201ENST00000587091 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MKL1-211ENST00000618196 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CEMIP-203ENST00000394685 7357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 APLP2-201ENST00000263574 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SGSM3-201ENST00000248929 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CCDC18-203ENST00000401026 4552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 HSPA8P9-201ENST00000485881 1943 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KIF9-208ENST00000452770 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PIGG-217ENST00000509768 3121 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LCA5-202ENST00000392959 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC009501.1-201ENST00000429952 2069 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MIR326-201ENST00000362220 95 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC233724.6-201ENST00000503184 1088 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TMEM211-203ENST00000640159 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC022400.8-201ENST00000623453 3599 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 PIAS2-201ENST00000324794 4543 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TRPM4-201ENST00000252826 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TCTN2-202ENST00000426174 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 LINC01114-202ENST00000424321 2112 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ITPR3-202ENST00000605930 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SMG6-203ENST00000536871 1865 ntTSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 MDM1-203ENST00000393543 2718 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 UGT3A1-201ENST00000274278 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 ZBED2-201ENST00000317012 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 KCNIP3-202ENST00000360990 2798 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 TNFSF8-201ENST00000223795 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
SMIM1B2RUZ4 RIC8B-201ENST00000355478 3207 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms