Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 PEMT-204ENST00000395783 1008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 FRGCA-201ENST00000424933 422 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MKNK1-205ENST00000428112 1270 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 HNRNPA1P10-201ENST00000444945 962 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TMEM222-203ENST00000464813 1071 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 RN7SL684P-201ENST00000465665 294 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ANAPC15-209ENST00000538919 849 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 NEK4P3-201ENST00000604859 544 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 MUC1-225ENST00000612778 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Q9Y3F1 VRK3-201ENST00000316763 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LYPLA1-202ENST00000343231 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 OR2V2-201ENST00000328275 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AQP7-202ENST00000377425 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MIR632-201ENST00000385193 94 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SNORA50D-201ENST00000408059 134 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC093495.1-201ENST00000420253 1067 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RIC3-205ENST00000425599 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC011284.1-201ENST00000427920 856 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AL773545.2-201ENST00000442149 472 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 HOXC-AS3-203ENST00000514702 368 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 ZFP1-207ENST00000567481 493 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC00514-203ENST00000573465 313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RN7SL602P-201ENST00000578326 324 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SEPT4-AS1-203ENST00000580769 1000 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RN7SL718P-201ENST00000581254 303 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC016582.2-202ENST00000587765 1094 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC123912.6-201ENST00000612657 315 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PDCD6-213ENST00000618970 931 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SNORA50D-202ENST00000627561 132 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 STK16-202ENST00000409260 1493 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PROZ-201ENST00000342783 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SLC39A6-204ENST00000590986 3003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 APOBEC3A-201ENST00000249116 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 CCDC159-209ENST00000588790 1408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NR1H4-203ENST00000392986 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PINX1-201ENST00000314787 1545 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LINC02486-201ENST00000604157 3000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 DRD3-202ENST00000383673 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Q9Y3F1 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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