Protein–RNA interactions for Protein: Q9P219

CCDC88C, Protein Daple, humanhuman

Predictions only

Length 2,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC88CQ9P219 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LDB3-209ENST00000623056 2314 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FES-201ENST00000328850 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 HMGCS2-201ENST00000369406 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LY6E-208ENST00000520531 490 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC006435.2-201ENST00000574290 846 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MAN2B1-203ENST00000456935 3184 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 B3GAT1-202ENST00000392580 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 DNM3-201ENST00000355305 3280 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TOX2-202ENST00000358131 2605 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SAMD15-201ENST00000216471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ABAT-213ENST00000567812 1959 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SMAD2-212ENST00000591214 1714 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 DHX16-202ENST00000376442 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ZNF747-202ENST00000395094 3504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NIPAL3-203ENST00000358028 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PRKAR2A-202ENST00000296446 3318 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ATP2C1-201ENST00000328560 3484 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 TPM1-223ENST00000560445 485 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 FAM156A-221ENST00000622447 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 LINC01662-201ENST00000342888 1859 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 INVS-201ENST00000262456 2968 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
CCDC88CQ9P219 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms