Protein–RNA interactions for Protein: Q96P50

ACAP3, Arf-GAP with coiled-coil, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAP3Q96P50 SAP30L-203ENST00000440364 792 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TCL1A-205ENST00000555202 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FGGY-204ENST00000371218 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 LTB4R-203ENST00000396789 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SLC47A1-206ENST00000571335 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 VAC14-AS1-201ENST00000398177 2145 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC003986.1-201ENST00000452700 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CHID1-202ENST00000429789 1289 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC107464.3-201ENST00000609172 737 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 HPX-213ENST00000615166 826 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 DSTN-203ENST00000474024 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FOXP1-202ENST00000318789 7114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 FOXP1-222ENST00000615603 7140 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AIF1L-205ENST00000372301 671 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 HORMAD2-AS1-202ENST00000432568 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 C12orf10-207ENST00000549488 840 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACAP3Q96P50 SLC37A3-201ENST00000326232 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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