Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 DUSP18-204ENST00000403268 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AGL-203ENST00000361915 7368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SIGLEC16-202ENST00000602139 2510 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 GPC6-201ENST00000377047 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 MUC1-203ENST00000342482 537 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 UBL4A-201ENST00000369653 711 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 MIR4750-201ENST00000584564 56 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC007881.3-201ENST00000608897 607 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AC087392.5-201ENST00000612517 489 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PTK7-203ENST00000345201 4071 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RPS6KC1-206ENST00000543354 4082 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SH3BP5L-201ENST00000366472 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ZMIZ2-206ENST00000441627 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 PHYHD1-203ENST00000372592 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CUL1-201ENST00000325222 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 SIMC1-205ENST00000443967 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
ATP2A3Q93084 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 PPP6R2-202ENST00000359139 4035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 MARK2P16-201ENST00000605714 1723 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 HAGLR-202ENST00000416928 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 RHD-203ENST00000357542 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 MED22-209ENST00000610888 3867 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 SSTR3-201ENST00000610913 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
ATP2A3Q93084 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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