Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C5AR1-201ENST00000355085 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 USP19-207ENST00000434032 4677 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC00940-201ENST00000418006 2350 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CMC4-201ENST00000369479 864 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC011365.2-201ENST00000520041 810 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LAMP2-203ENST00000434600 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NPNT-211ENST00000506666 2187 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 STAG3-206ENST00000426455 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FLNC-202ENST00000346177 9042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TRIM46-205ENST00000392451 3195 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MAGED4B-201ENST00000335504 2578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RNF145-202ENST00000424310 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ALPK3-201ENST00000258888 10917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NDRG2-251ENST00000556147 2880 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PROM2-201ENST00000317620 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CYP4F11-204ENST00000591841 2531 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 BDKRB2-202ENST00000542454 6845 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AP000347.1-201ENST00000417194 5004 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AFF1-201ENST00000307808 9390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
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