Protein–RNA interactions for Protein: Q08708

CD300C, CMRF35-like molecule 6, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD300CQ08708 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 PNPLA6-204ENST00000545201 4502 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SLFNL1-AS1-201ENST00000626479 4800 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 GPM6B-202ENST00000355135 1673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SHMT2-205ENST00000553474 1765 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 RGS12-204ENST00000382788 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 NCBP2-206ENST00000447325 2216 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 COIL-201ENST00000240316 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 EPB41L1-203ENST00000373941 2652 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 LRRC37A7P-201ENST00000583900 2759 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ZFP64-202ENST00000346617 2876 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ANKRD18CP-201ENST00000354752 2980 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ARSK-201ENST00000380009 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 BSND-201ENST00000371265 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 MKX-202ENST00000419761 3638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 GPR132-201ENST00000329797 3660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 MAPKAPK5-206ENST00000550735 11349 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 KCTD7-209ENST00000640385 4118 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 EMBP1-203ENST00000622787 4235 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SV2A-202ENST00000369146 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CNTNAP1-201ENST00000264638 5276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 NAGA-201ENST00000396398 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 GRHL3-203ENST00000356046 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 VAV1-202ENST00000539284 2627 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 LINC02133-202ENST00000569726 2626 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 HCG18-236ENST00000438412 2440 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 EPS8L3-201ENST00000361852 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 GIMAP1-GIMAP5-201ENST00000611999 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 NDRG2-201ENST00000298684 1784 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 NPNT-202ENST00000379987 4598 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ST5-201ENST00000313726 4507 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ARF3-201ENST00000256682 4105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 FBLN2-201ENST00000295760 4127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 NEU3-201ENST00000294064 6728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ARHGAP27-212ENST00000532038 3694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 C19orf47-208ENST00000582783 3628 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 TLR6-202ENST00000436693 5880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 TLE3-222ENST00000560589 3509 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ARMC1-201ENST00000276569 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 ADAMTS5-201ENST00000284987 9056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AF067845.2-201ENST00000617093 3049 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 PRDM15-207ENST00000447207 4928 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 RAB7B-201ENST00000617070 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 AC138761.4-202ENST00000577956 2552 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CNBD2-204ENST00000489667 2531 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CAPN10-AS1-201ENST00000567819 4000 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 SPRTN-204ENST00000391858 3559 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 DDR1-232ENST00000418800 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 PPFIA4-202ENST00000295706 6395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 RNF34-203ENST00000392465 2051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 TSPYL1-201ENST00000368608 3326 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CD300CQ08708 PTPN7-202ENST00000367279 3265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms