Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 KRT75-201ENST00000252245 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC007279.1-201ENST00000448547 837 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RASSF3-204ENST00000542104 3492 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RGMB-201ENST00000308234 4580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NOB1-201ENST00000268802 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ALDOA-202ENST00000395240 1447 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ALDH7A1-201ENST00000409134 4964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 MKL1-202ENST00000396617 4505 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ZNF263-202ENST00000538765 1721 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NDUFB6-203ENST00000379847 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 A1CF-202ENST00000373993 1997 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CALD1Q05682 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms