Protein–RNA interactions for Protein: P50613

CDK7, Cyclin-dependent kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK7P50613 FAM167A-AS1-202ENST00000533578 1222 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ALG10B-203ENST00000551464 571 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AC012617.1-201ENST00000586345 797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AC026336.4-201ENST00000624565 1050 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HTR3E-205ENST00000436361 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ACTN4-203ENST00000424234 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 LSS-202ENST00000397728 4936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDK7P50613 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MSRA-201ENST00000317173 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ARHGAP9-213ENST00000550288 2818 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 NPPA-202ENST00000376480 855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 GAPDH-203ENST00000396858 1292 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AC004895.1-203ENST00000428901 540 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MOCS1-207ENST00000432280 1071 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 LINC01278-201ENST00000433061 529 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AC099548.2-201ENST00000491047 571 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 COQ10BP2-201ENST00000513804 724 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 LINC00301-203ENST00000527161 749 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 LINC01278-206ENST00000610088 554 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 NPPA-203ENST00000610706 849 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 GPC3-202ENST00000394299 2379 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 EPHX2-207ENST00000521400 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDK7P50613 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 MPHOSPH10-205ENST00000498451 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 NECTIN1-203ENST00000341398 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SIRPB3P-201ENST00000340424 1216 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 TSC22D3-202ENST00000372382 1216 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 TMSB4X-202ENST00000380635 767 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 RPS9-202ENST00000391751 510 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 EEF1DP2-201ENST00000433698 843 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDK7P50613 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms