Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MANBAL-201ENST00000373605 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TRIM3-203ENST00000525074 3044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC000068.1-201ENST00000431090 2097 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PAK3-211ENST00000518291 2098 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TMPRSS4-213ENST00000522824 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 C1QTNF6-201ENST00000337843 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LINC01993-201ENST00000374945 2934 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 EEF2KMT-201ENST00000427587 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 DNMT3B-205ENST00000443239 2674 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PCDHB13-201ENST00000341948 5061 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FAM86C1-202ENST00000359244 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LINC01301-202ENST00000506428 2444 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PHB-215ENST00000617874 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PID1-204ENST00000409462 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PHACTR2-202ENST00000367582 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 SGMS1-203ENST00000429490 3634 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ZNF799-202ENST00000430385 2583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TMEM25-208ENST00000524725 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AP001972.5-201ENST00000624624 2338 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TMEM182-202ENST00000409528 3112 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RBM10-206ENST00000628161 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GOSR2-233ENST00000640068 3103 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ITFG2-201ENST00000228799 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NUP54-201ENST00000264883 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 BEND6-202ENST00000370746 2379 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 DNAJC19-209ENST00000491873 769 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AL356756.1-201ENST00000550941 551 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MICAL1-208ENST00000630715 3678 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 MAPK14-202ENST00000229795 4319 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CCT6P3-201ENST00000419314 3702 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 CYP11B1-203ENST00000377675 2280 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 TMEM30A-203ENST00000475111 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 ITSN2-203ENST00000406921 4563 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 AP001258.1-201ENST00000501817 2110 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 EFHD1-203ENST00000409708 1817 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 LHFPL1-201ENST00000371968 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DDIT3P35638 STIM1-201ENST00000300737 4038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms