Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CR381653.1-201ENST00000622961 812 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 SLC35C2-213ENST00000543605 5740 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 LINC01535-206ENST00000592712 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 KLHL13-209ENST00000545703 3322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CILP2-201ENST00000291495 4199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 MSH2-206ENST00000543555 3024 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 DDC-214ENST00000622873 1839 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 PPFIA4-203ENST00000367240 6434 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 MYO1C-218ENST00000575158 4804 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 GUCY1B2-205ENST00000532104 1912 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 OTOF-202ENST00000338581 4954 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AC008620.2-201ENST00000510294 1569 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AC125807.2-201ENST00000513358 3514 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 FUT3-207ENST00000589620 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 MOB3C-203ENST00000371940 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 ADAMTSL2-203ENST00000393061 4270 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AMT-256ENST00000638063 1783 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 IGHV4-39-201ENST00000390619 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 OGFR-AS1-201ENST00000431361 668 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 SMYD4-201ENST00000305513 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 MN1-201ENST00000302326 7556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 GMPR2-206ENST00000557854 2025 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 RPL13AP3-202ENST00000494676 1473 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 WDSUB1-201ENST00000358147 1535 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 KCTD9-201ENST00000221200 3401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 LINC00665-205ENST00000585356 1557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 GTF2IRD2-201ENST00000451013 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 ELP4-228ENST00000640954 1612 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 PBRM1-204ENST00000394830 5071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 KIRREL3-202ENST00000525704 2474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 LPCAT1-201ENST00000283415 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MARCKSP29966 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 BRPF1-205ENST00000433861 4304 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 LINC00637-201ENST00000556586 2056 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 CFLAR-203ENST00000341222 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MARCKSP29966 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms