Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PNMA5-201ENST00000361887 3197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SP7-202ENST00000536324 3151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ARHGAP36-202ENST00000370921 2447 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GGTA1P-205ENST00000495328 3478 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPR55-205ENST00000622008 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG5-205ENST00000377740 3550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 STRA6-206ENST00000449139 2732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPP2R1A-205ENST00000462990 2730 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC119674.2-203ENST00000642129 1675 ntAPPRIS P5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF630-206ENST00000442455 2829 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGEA11-202ENST00000355220 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPATS2L-205ENST00000409151 1979 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF142-205ENST00000449707 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMIM10L1-201ENST00000622602 4795 ntAPPRIS P1 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ECM1-202ENST00000369047 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PISD-203ENST00000397500 2194 ntTSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SEPT9-204ENST00000427180 3635 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM102A-203ENST00000373095 4144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRCH1-203ENST00000389798 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHG2-203ENST00000425673 8132 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC4A9-201ENST00000432095 3086 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01164-201ENST00000341866 3384 ntTSL 2 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SOX13-203ENST00000367204 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRBP1-203ENST00000377807 3792 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TCF21-202ENST00000367882 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REXO5-201ENST00000261377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC006254.1-201ENST00000468472 5640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG4-204ENST00000450593 4978 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OPRK1-206ENST00000613482 4682 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMACR-201ENST00000335606 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LRFN3-204ENST00000588831 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBP2-208ENST00000437268 3580 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DNAJB12-204ENST00000461919 2369 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PRKAG2-202ENST00000392801 2281 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF674-201ENST00000414387 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATAT1-202ENST00000319027 2061 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CPPED1-203ENST00000433677 1993 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPAG8-201ENST00000340291 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DDX19B-202ENST00000355992 1692 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SNIP1-201ENST00000296215 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C12orf56-201ENST00000333722 3936 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
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SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POLR1B-216ENST00000537335 4961 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TRPV1-204ENST00000425167 2607 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMCO4-202ENST00000375127 2403 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPLOC4-202ENST00000374747 5538 ntTSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC137834.1-201ENST00000548184 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LIG1-201ENST00000263274 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATF4P4-201ENST00000393544 1930 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 POFUT2-203ENST00000349485 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TNIP1-201ENST00000315050 2785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 OSBPL7-202ENST00000392507 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMU1-201ENST00000397149 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SPTY2D1-201ENST00000336349 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LINC01561-201ENST00000369071 2176 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC10.07□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CARF-213ENST00000438828 3574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TESPA1-201ENST00000316577 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SYT4-205ENST00000590752 1765 ntTSL 2 BASIC10.06□□□□□ -0.8
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