Protein–RNA interactions for Protein: F8W031

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8W031 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 LAMP5-202ENST00000427562 1309 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 HSPH1-201ENST00000320027 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 CICP16-201ENST00000502609 2813 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 VPREB1-202ENST00000403807 755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 MIR1307-201ENST00000408840 149 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 UBR5-AS1-202ENST00000520820 800 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 ZNF571-AS1-204ENST00000587121 822 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 CLEC20A-202ENST00000623247 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 TTC28-AS1-207ENST00000428584 5859 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
F8W031 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 RAB15-201ENST00000267512 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AL117190.1-201ENST00000637474 1985 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 NSMCE1-201ENST00000361439 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 PSAT1P2-201ENST00000426107 972 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 C10orf113-201ENST00000529198 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 CLNS1A-211ENST00000532069 898 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AC092862.1-201ENST00000541534 533 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 CR383656.13-201ENST00000550928 563 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AL512310.10-201ENST00000555580 563 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 RARS-210ENST00000626454 177 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
F8W031 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8W031 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
F8W031 KIAA1257-204ENST00000511438 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8W031 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8W031 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8W031 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
F8W031 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 PES1P2-201ENST00000449745 1735 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
F8W031 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms