Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 PNPT1-207ENST00000625249 216 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 BX322534.1-201ENST00000635574 241 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC215524.1-201ENST00000635696 241 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RSPH4A-202ENST00000368580 1410 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ATP6V0A1-206ENST00000585525 2679 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PDLIM5-203ENST00000359265 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CST1-202ENST00000398402 655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TRAPPC4-202ENST00000434101 794 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA3P12-201ENST00000437410 1063 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC117945.1-201ENST00000451375 463 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SMAD1-AS1-201ENST00000513542 481 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PHBP18-201ENST00000546648 813 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ANAPC11-206ENST00000571874 636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LINC00675-202ENST00000581851 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PTN-202ENST00000393083 1599 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ERG-211ENST00000453032 1595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 VAPB-202ENST00000395802 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 FAM156A-208ENST00000615092 2098 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 STAMBP-204ENST00000409707 1649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HDGF-202ENST00000368206 960 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PITHD1-202ENST00000374524 1292 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CELA3A-202ENST00000374663 649 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KRT18P33-201ENST00000398525 1043 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 SERF2-204ENST00000402131 586 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RPL18AP16-201ENST00000424057 531 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RNLS-203ENST00000437752 525 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC008747.1-201ENST00000592220 442 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 Metazoa_SRP.153-201ENST00000620153 341 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DAXX-201ENST00000266000 2606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 PSMC3IP-201ENST00000253789 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 AC007431.1-201ENST00000578662 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 RDH12-203ENST00000551171 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CATSPERD-202ENST00000381624 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 LILRP2-202ENST00000413572 1383 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 HNRNPC-205ENST00000553300 1375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVV-1B6SEH8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
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