Protein–RNA interactions for Protein: B5MD39

GGTLC3, Putative glutathione hydrolase light chain 3, humanhuman

Predictions only

Length 225 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGTLC3B5MD39 CCNY-203ENST00000374704 3960 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PRR12-201ENST00000418929 6955 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC131902.2-201ENST00000566892 2172 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FLNA-203ENST00000369850 8382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 EIF3F-201ENST00000309828 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ANKRD20A1-201ENST00000562196 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ELAVL1-201ENST00000407627 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ELN-234ENST00000621115 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BAIAP3-207ENST00000562208 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PAX8-203ENST00000348715 3966 ntTSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NLRP2-202ENST00000339757 3422 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TBX4-202ENST00000393853 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SLC46A1-207ENST00000612814 6376 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CRY2-212ENST00000616623 4204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ZFAND3-203ENST00000373391 3001 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PGBD1-201ENST00000259883 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SRP54-201ENST00000216774 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM90A26-201ENST00000512047 2492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CEP112-202ENST00000392769 3517 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GK-205ENST00000378946 3638 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SIRPA-203ENST00000400068 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CACNA1G-203ENST00000358244 7030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 IKZF1-206ENST00000359197 3487 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MTUS1-204ENST00000381869 6256 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 WNT9A-201ENST00000272164 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NPC1-201ENST00000269228 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 Z98885.2-201ENST00000565177 1567 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DYNC1I2-204ENST00000409317 2196 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MANEA-AS1-201ENST00000564541 2268 ntBASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 SRPRA-201ENST00000332118 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 NFATC1-203ENST00000329101 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 DNM3-202ENST00000367731 7613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 TNNI1-202ENST00000361379 5413 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 KCNH4-202ENST00000607371 3723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 COL6A2-204ENST00000409416 3430 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 MSH6-214ENST00000616033 3429 ntTSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 STAT6-202ENST00000454075 3037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.67
GGTLC3B5MD39 IL21R-204ENST00000564089 3009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.84□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms