Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPV0

CEP164, Centrosomal protein of 164 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP164Q9UPV0 BTF3-202ENST00000380591 1237 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SLC2A11-208ENST00000405847 730 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HMGN1P4-201ENST00000419500 290 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PLAC9P1-203ENST00000440031 223 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC012513.2-201ENST00000441511 1137 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RN7SL477P-201ENST00000488440 286 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RN7SL2-201ENST00000490232 300 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PDPN-208ENST00000509009 571 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC105424.1-201ENST00000514583 209 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HAX1-211ENST00000532105 771 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 FOS-205ENST00000555242 629 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC009093.2-201ENST00000563477 546 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RN7SL4P-201ENST00000584058 295 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC099552.4-201ENST00000624248 949 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 UBBP4-202ENST00000584755 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SS18-201ENST00000269137 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CLEC10A-202ENST00000416562 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PRMT5-202ENST00000324366 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AL031056.1-202ENST00000635954 2193 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PRDX3P2-201ENST00000447051 611 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC090152.1-202ENST00000518993 1079 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC092634.5-206ENST00000593670 812 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SKINT1L-204ENST00000604015 540 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC099795.2-201ENST00000639582 440 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC008038.1-201ENST00000634247 1314 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 EPB42-203ENST00000540029 2098 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC011239.2-201ENST00000624820 1489 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ECI2-207ENST00000465828 1548 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MYL3-201ENST00000292327 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LSM2-208ENST00000375661 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 FTLP3-201ENST00000427242 528 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PRSS45-201ENST00000442359 687 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PDLIM2-212ENST00000443561 701 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC010997.1-201ENST00000447646 350 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 BCDIN3D-AS1-202ENST00000549124 468 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LINC00677-201ENST00000558224 486 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 INCA1-202ENST00000574617 1260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 MIEF2-206ENST00000578174 589 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC100778.4-201ENST00000581232 582 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 NSRP1-213ENST00000584423 482 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 GTF3A-209ENST00000640289 1098 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SNX11-202ENST00000393405 2733 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TRIML2-207ENST00000512729 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 ADCK1-201ENST00000238561 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SPC25-201ENST00000282074 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CEP164Q9UPV0 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.6 ms