Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM3

KIAA1549, UPF0606 protein KIAA1549, humanhuman

Predictions only

Length 1,950 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA1549Q9HCM3 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MFAP3-201ENST00000322602 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 FADS1-206ENST00000460649 1559 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 LSS-201ENST00000356396 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 TAGLN-207ENST00000532870 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZNF683-205ENST00000436292 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CD300LG-203ENST00000377203 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC005486.1-201ENST00000466775 216 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 WASHC1-201ENST00000442898 1827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CAMKK2-204ENST00000392473 2967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 DNMT3L-204ENST00000628202 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AXL-203ENST00000593513 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 KLKP1-203ENST00000600104 1532 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ALG6-202ENST00000371108 3371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 PSIP1-204ENST00000380738 3364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MAL-204ENST00000354078 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 RBM14-204ENST00000409738 372 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZMIZ1-AS1-202ENST00000440151 814 ntTSL 3 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 TREHP1-201ENST00000531328 465 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MIR4265-201ENST00000582152 99 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MIR4326-201ENST00000582203 59 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 APOBEC3H-207ENST00000613996 465 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MIR6756-201ENST00000616240 63 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 EFHC2-202ENST00000420999 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AMACR-203ENST00000382072 2919 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ABCC6P1-201ENST00000546162 2943 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 GPN1-211ENST00000610189 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC013460.1-202ENST00000435062 2253 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AAR2-201ENST00000320849 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 TMEM95-201ENST00000330767 1169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 C20orf141-201ENST00000380589 730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AL355537.2-201ENST00000453367 375 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 C12orf57-204ENST00000540506 551 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC008687.1-201ENST00000591656 786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AL009176.1-201ENST00000607876 650 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 AC011451.3-201ENST00000634951 582 ntTSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 SNAPC2-206ENST00000597584 1413 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 TMEM56-RWDD3-202ENST00000604534 1491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 LPCAT4-209ENST00000617710 1719 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
KIAA1549Q9HCM3 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms