Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 COL16A1-202ENST00000373668 3643 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PLD2-201ENST00000263088 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RN7SL128P-201ENST00000467883 305 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL359219.1-201ENST00000556311 934 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC010127.1-202ENST00000597623 713 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AP000356.3-203ENST00000614808 601 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PHB-210ENST00000511832 1509 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CILP2-202ENST00000586018 4234 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZNF691-201ENST00000372502 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IFT22-210ENST00000517481 1657 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BARX1-AS1-201ENST00000453045 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 KCNK9-201ENST00000303015 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 EPPIN-201ENST00000336443 1217 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 UROS-201ENST00000368774 744 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RHOC-205ENST00000369636 786 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC092903.1-201ENST00000466506 262 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 BBS1-203ENST00000455748 1552 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC239809.3-201ENST00000599640 4266 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CLASRP-204ENST00000544944 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 HLA-DMA-202ENST00000395303 1007 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL583839.1-201ENST00000445280 691 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 MUSTN1-202ENST00000486659 622 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AC005845.1-201ENST00000539206 653 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 RMDN3-201ENST00000260385 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 C17orf80-202ENST00000268942 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SDK2Q58EX2 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms