Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI63

KRTAP20-1, Keratin-associated protein 20-1, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP20-1Q3LI63 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GJB1-201ENST00000361726 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLC6A4-203ENST00000401766 6543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SULT1A4-201ENST00000360423 1390 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PHTF2-204ENST00000415251 1738 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GK-204ENST00000378945 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZWINT-201ENST00000318387 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZSCAN5DP-201ENST00000600684 1488 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL391421.1-201ENST00000372387 1922 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 INSC-205ENST00000525218 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RABGAP1-213ENST00000616002 1595 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 STAU2-214ENST00000521451 2712 ntTSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL034548.1-201ENST00000608495 1672 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ACAT1-202ENST00000299355 1345 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FDFT1-218ENST00000530664 1761 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 YIPF1-201ENST00000072644 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF485-202ENST00000374435 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CLU-202ENST00000405140 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 FAM47E-203ENST00000510197 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CFAP206-202ENST00000369562 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 VRK3-202ENST00000377011 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2V1-222ENST00000557021 2258 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SPATA22-201ENST00000268981 1280 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 RN7SKP163-201ENST00000363221 330 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 H3F3A-203ENST00000366815 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 SALL4-202ENST00000371539 1151 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MIR200B-201ENST00000384997 95 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 KRTAP4-4-201ENST00000390661 1081 ntAPPRIS P1 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 CD33-202ENST00000391796 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL513475.2-201ENST00000402316 392 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 ZNF589-202ENST00000412564 593 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC011247.1-202ENST00000417039 1156 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AC079987.1-201ENST00000420181 123 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC01678-202ENST00000424921 475 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00454-201ENST00000425483 503 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 LINC00539-203ENST00000434601 960 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL357060.2-204ENST00000448942 963 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 MYL6P1-201ENST00000449877 453 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
KRTAP20-1Q3LI63 AL035587.1-201ENST00000450671 679 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms