Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

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Length 152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 PLEKHG3-201ENST00000247226 10351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 BICDL2-204ENST00000573514 3519 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MYO9A-202ENST00000424560 4008 ntTSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ADAM19-201ENST00000257527 6481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 YTHDC1-201ENST00000344157 6232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PLEKHG2-206ENST00000458508 3898 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ECHDC1-220ENST00000528402 1449 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC015802.1-201ENST00000588104 1449 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 STARD13-202ENST00000336934 5917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SLC45A4-203ENST00000519067 7483 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.66□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 AC114689.3-201ENST00000583687 2991 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 RBM44-201ENST00000316997 4282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 IL1RAPL2-202ENST00000372582 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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RRN3P1Q2M238 RNH1-224ENST00000534797 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DGCR5-203ENST00000438934 5492 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CCDC88A-207ENST00000436346 9811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 DPYSL5-201ENST00000288699 5209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 FAHD2A-201ENST00000233379 4757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
RRN3P1Q2M238 SNX19-211ENST00000533214 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
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