Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CCT6B-201ENST00000314144 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 MMP14-201ENST00000311852 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 CPNE5-201ENST00000244751 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NUP133-201ENST00000261396 5207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP4-202ENST00000340491 2392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GRIN1-204ENST00000371553 3751 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DDX43-201ENST00000370336 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SNED1-205ENST00000405547 7986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ENG-204ENST00000480266 2804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C16orf82-201ENST00000418886 2268 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3E-201ENST00000621587 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AMER2-201ENST00000357816 10055 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 DIRAS3-201ENST00000370981 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PEA15-203ENST00000368077 1021 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1217-209ENST00000430453 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 KIAA1217-211ENST00000458595 5977 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 IFT57-201ENST00000264538 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CHD5-201ENST00000262450 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 HSP90AA1-201ENST00000216281 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CEACAM20-204ENST00000617951 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CFAP43-201ENST00000278064 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 PTPRVP-205ENST00000641549 5067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 TRMT1L-201ENST00000367506 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 NLRP7-207ENST00000590030 3209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CSPP1Q1MSJ5 USP19-202ENST00000398888 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
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