Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 UBXN11-202ENST00000357089 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AL449403.1-201ENST00000432783 1577 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 DOK4-210ENST00000566936 2851 ntTSL 3 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 NCBP2L-202ENST00000639756 1953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 DCAF16-201ENST00000382247 4548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ZC3H18-202ENST00000452588 3211 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 KIF25-AS1-202ENST00000456585 2795 ntTSL 2 BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 SPOCK2-201ENST00000317376 5328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TMPRSS7-201ENST00000419127 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 COX4I1-208ENST00000564903 1481 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CYP26B1-205ENST00000546307 4331 ntTSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 ACOT11-201ENST00000343744 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 MATR3-233ENST00000504203 2243 ntTSL 2 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 TUFT1-202ENST00000368848 3033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 RBMXL3-201ENST00000424776 3442 ntAPPRIS P1 BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 CPLX2-201ENST00000359546 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 NCOA7-203ENST00000392477 6457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 AC004834.1-202ENST00000638785 1737 ntTSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
CTF1Q16619 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.41
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CTF1Q16619 C11orf87-201ENST00000327419 5884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SERPINA13P-201ENST00000469935 1718 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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CTF1Q16619 MIR9-3HG-201ENST00000536780 4778 ntTSL 3 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CTPS1-202ENST00000372621 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SQSTM1-201ENST00000360718 2253 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 PLOD2-201ENST00000282903 3732 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 RFX5-202ENST00000368870 2459 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 DNASE1L1-205ENST00000369809 3008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 AC090136.3-201ENST00000520834 2704 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
CTF1Q16619 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
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