Protein–RNA interactions for Protein: Q14CM0

FRMPD4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD4Q14CM0 TROAP-213ENST00000550709 778 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PPCDC-206ENST00000564923 757 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CR589904.1-202ENST00000611154 660 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CCDC113-206ENST00000616795 891 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 Z98885.3-201ENST00000624882 1757 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 FAM168A-204ENST00000450446 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GLP2R-204ENST00000574745 1882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 YPEL1-201ENST00000339468 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 C9orf47-201ENST00000334490 4829 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AF013593.1-201ENST00000458074 1487 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 RBPJ-206ENST00000361572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MDS2-201ENST00000374555 1029 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AC099567.1-201ENST00000414418 931 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 LINP1-201ENST00000417112 917 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SNHG15-205ENST00000580458 710 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SNORA50.1-201ENST00000628590 135 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PFDN5-220ENST00000628881 231 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 EIF3F-209ENST00000640290 372 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SUOX-201ENST00000266971 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GAP43-201ENST00000305124 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MECP2-217ENST00000628176 1712 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MTG2-201ENST00000370823 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CCNF-202ENST00000397066 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 HPGD-201ENST00000296521 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SPATA8-201ENST00000328504 1083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ABCD1P4-201ENST00000399687 604 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 AP001628.2-201ENST00000420273 784 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 POLR2H-203ENST00000430783 1159 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 C21orf62-204ENST00000490358 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 ACTN1-AS1-202ENST00000553961 599 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 DCTPP1-202ENST00000565758 749 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SEPT14P19-201ENST00000587432 336 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GFRA1-201ENST00000355422 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 OR2I1P-209ENST00000641730 5365 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 CYP51A1P3-201ENST00000400072 1428 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
FRMPD4Q14CM0 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms