Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PIGV-202ENST00000374145 2713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SPRY4-AS1-203ENST00000443800 566 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC006450.3-201ENST00000453529 2146 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 SHBG-207ENST00000570547 801 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CCDC187-203ENST00000569961 3158 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 TNFAIP8L1-202ENST00000536716 3845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 DACT3-AS1-201ENST00000500689 1304 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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FOXF1Q12946 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 FLJ37035-201ENST00000419400 446 ntTSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 LINC01563-201ENST00000456235 750 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 KRTAP10-4-203ENST00000622352 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 PTPRA-201ENST00000216877 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
FOXF1Q12946 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
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