Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 RTP2-201ENST00000358241 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 DLX4-206ENST00000611342 1662 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 MAGEH1-201ENST00000342972 1462 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 FATE1-201ENST00000370350 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AL121994.1-201ENST00000413189 402 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC007383.2-201ENST00000420509 752 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 BICD1P1-201ENST00000457832 1222 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 RN7SL22P-201ENST00000471800 269 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CMC2-202ENST00000486645 766 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC113346.2-201ENST00000502684 457 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SEMA6A-AS1-206ENST00000514214 782 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC100797.1-201ENST00000520760 316 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 UBA3-212ENST00000630585 390 ntTSL 4 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 HMOX2-201ENST00000219700 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 MARCH9-202ENST00000548358 1668 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PPP3CA-202ENST00000394853 3604 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 HRASLS2-201ENST00000255695 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 LYG2-201ENST00000333017 862 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 OPN1MW2-201ENST00000369929 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SUSD3-201ENST00000375469 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 NAA10-205ENST00000393712 908 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC013269.2-201ENST00000422631 727 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AL355482.2-201ENST00000428646 1145 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AL121972.2-201ENST00000431108 556 ntTSL 4 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC140481.2-201ENST00000457169 695 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 HAND2-AS1-208ENST00000504740 837 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 DNM1P17-201ENST00000512082 426 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC091564.7-201ENST00000545572 464 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 AC110285.1-201ENST00000572077 665 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PDHB-210ENST00000485460 1397 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 FBXO39-201ENST00000321535 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PRDM16-206ENST00000511072 4282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
CACNA1BQ00975 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms