Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 CFAP36-203ENST00000403007 759 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 AL354892.2-201ENST00000413088 403 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 CTHRC1-202ENST00000415886 571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 MUTYH-231ENST00000488731 740 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 ACSM5-206ENST00000575584 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 BLACE-202ENST00000616210 540 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 AC013472.1-203ENST00000380387 1966 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAP3K9P80192 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC005906.2-205ENST00000640862 1522 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 LCE2C-201ENST00000368783 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 YPEL4-209ENST00000534711 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC016266.1-201ENST00000557558 729 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 USB1-205ENST00000561743 1135 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TRMT112P3-201ENST00000580149 358 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 DHPS-207ENST00000594424 1172 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 LINC02246-204ENST00000625278 740 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 HPGD-209ENST00000510901 1535 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 INTS4P1-203ENST00000641008 3683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 L2HGDH-201ENST00000261699 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 USP38-202ENST00000510377 4135 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 BAG4-201ENST00000287322 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 YY1P1-201ENST00000427625 668 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC073094.1-201ENST00000453798 433 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC063952.3-201ENST00000467756 308 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 LINC02228-201ENST00000507600 534 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 LINC02171-201ENST00000508619 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 TUBB3-208ENST00000555576 572 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 MAX-218ENST00000557746 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAP3K9P80192 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms