Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 RIN2-202ENST00000440354 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZFP1-201ENST00000332307 1502 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ASB3-201ENST00000263634 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CREB3L4-204ENST00000368603 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CSF3-204ENST00000394149 1583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MST1-202ENST00000449682 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RBM4B-206ENST00000531036 1646 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HELLS-202ENST00000348459 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC016730.1-201ENST00000420828 832 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AADACL2-AS1-202ENST00000483843 628 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NDUFS6P1-201ENST00000485187 316 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LAMTOR4-209ENST00000488241 613 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HINT1-205ENST00000508488 703 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC090617.6-201ENST00000572790 443 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01746-201ENST00000621390 449 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC073862.5-201ENST00000624129 2027 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SIGLEC9-201ENST00000250360 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC008040.5-201ENST00000599781 1781 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PALLD-215ENST00000512127 2958 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SLC27A3-201ENST00000271857 3351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC024075.2-201ENST00000598112 1473 ntBASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.94□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ELAVL4-207ENST00000448907 1951 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PRDM16-201ENST00000270722 8690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LDB3-202ENST00000361373 5297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 STIM1-220ENST00000616714 4356 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 HNRNPLL-209ENST00000449105 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 EPB42-210ENST00000622454 2227 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 LINC01006-202ENST00000418309 640 ntTSL 3 BASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC7.93□□□□□ -1.14
RPS29P62273 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC7.93□□□□□ -1.14
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