Protein–RNA interactions for Protein: P40692

MLH1, DNA mismatch repair protein Mlh1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH1P40692 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AL669831.1-201ENST00000506640 6432 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 TCEA3-201ENST00000374601 1197 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 IGF1-205ENST00000424202 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC092573.1-201ENST00000433054 884 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AL356218.1-201ENST00000450864 353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 EIF2B1-205ENST00000539951 848 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC145207.8-201ENST00000580897 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC003043.1-201ENST00000588260 337 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC023421.2-201ENST00000589510 313 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HOXC11-202ENST00000546378 3261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AJUBA-201ENST00000262713 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SHMT2-203ENST00000449049 2121 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 KCNIP1-210ENST00000636734 1613 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FOXF1-201ENST00000262426 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CSAD-203ENST00000379846 1962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MT1H-201ENST00000332374 397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 XG-202ENST00000419513 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LINC00866-201ENST00000427379 418 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AP001269.2-201ENST00000590055 379 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ZNF677-204ENST00000594681 935 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC091769.1-201ENST00000619576 568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 ST5-261ENST00000626808 1071 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 COL11A2-203ENST00000374708 6209 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RARG-202ENST00000394426 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
MLH1P40692 CLEC18B-204ENST00000617101 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
MLH1P40692 FXYD3-208ENST00000604404 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms