Protein–RNA interactions for Protein: P38435

GGCX, Vitamin K-dependent gamma-carboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGCXP38435 FUT3-201ENST00000303225 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PCDHGA11-201ENST00000398587 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MGAT1-205ENST00000446023 3175 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MAMDC4-202ENST00000445819 3895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 POC5-202ENST00000428202 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 STEAP2-201ENST00000287908 6873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SLC26A6-202ENST00000337000 2317 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TRIB1-201ENST00000311922 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RIMS1-218ENST00000522291 3876 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CYTH1-215ENST00000591455 3286 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF274-210ENST00000610905 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DGCR8-201ENST00000351989 4514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LINC00278-201ENST00000425031 528 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 THRB-AS1-202ENST00000438096 702 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC099548.2-209ENST00000480264 625 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 THEMIS2-201ENST00000328928 2337 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CDK11B-203ENST00000341832 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC005014.1-201ENST00000432006 2976 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TMPO-202ENST00000266732 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 RPP30-202ENST00000371703 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 TMBIM1-201ENST00000258412 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PTPRH-202ENST00000376350 3877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 FNTB-201ENST00000246166 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CTTN-201ENST00000301843 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PEG10-205ENST00000612748 2585 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LSM14A-203ENST00000544216 3596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC012435.1-201ENST00000563287 3385 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 ANK1-202ENST00000289734 8297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 KLHL32-206ENST00000544166 2864 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CC2D1A-201ENST00000318003 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 CDC20B-203ENST00000381375 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GGCXP38435 SERPING1-204ENST00000378324 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms