Protein–RNA interactions for Protein: P31947

SFN, 14-3-3 protein sigma, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFNP31947 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
SFNP31947 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 ZSCAN2-202ENST00000327179 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 ZKSCAN4-201ENST00000377294 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 ALDH1A3-202ENST00000346623 3104 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 FGFR1-202ENST00000335922 4157 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 PIGL-201ENST00000225609 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 GGTLC4P-201ENST00000402176 664 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC073210.1-201ENST00000414799 232 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMEM202-AS1-201ENST00000562573 723 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 ARL17B-203ENST00000570618 1140 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 MIR3940-201ENST00000579148 102 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 ATF7-212ENST00000591397 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC008982.2-201ENST00000600473 493 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 CRYM-202ENST00000543948 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 SLC25A20-202ENST00000430379 1576 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 SALL4P6-201ENST00000429385 1691 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 C14orf39-201ENST00000321731 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
SFNP31947 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 PLEKHG6-201ENST00000011684 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 RN7SL23P-201ENST00000484055 275 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC117503.4-201ENST00000623229 1418 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 RNF123-203ENST00000433785 1555 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 HECW1-203ENST00000453890 5169 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 B4GALT3-202ENST00000367998 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 LILRB3-201ENST00000245620 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 UBE2V1-224ENST00000625172 2297 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
SFNP31947 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 PGD-201ENST00000270776 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC009542.1-201ENST00000412549 1810 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 MINDY1-205ENST00000493834 1546 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 CELF4-217ENST00000591282 1461 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SSR4-202ENST00000370085 526 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 CXCL12-202ENST00000374426 470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 CHTF8-202ENST00000398235 1073 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 SNORA50C-201ENST00000408535 133 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AL022332.1-202ENST00000432495 426 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
SFNP31947 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms