Protein–RNA interactions for Protein: P10071

GLI3, Transcriptional activator GLI3, humanhuman

Predictions only

Length 1,580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI3P10071 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SMIM26-202ENST00000435844 575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HNRNPA1P9-201ENST00000450624 950 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 EEF1GP1-201ENST00000457231 1299 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TLE2-205ENST00000586422 389 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BX088651.4-202ENST00000428895 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL590399.1-202ENST00000429818 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL512625.1-202ENST00000476224 1480 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CACNA2D4-209ENST00000538450 1498 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FCRLA-202ENST00000294796 766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC024475.2-201ENST00000312173 879 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MGST3-204ENST00000367888 778 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL356653.1-201ENST00000402743 360 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ATP6V1B1-AS1-201ENST00000422761 1129 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FAM153C-208ENST00000511189 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AP003170.2-201ENST00000544730 786 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC007998.2-201ENST00000589258 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SMIM22-206ENST00000589327 629 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ZFHX4-AS1-201ENST00000518143 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SHCBP1-201ENST00000303383 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC018904.2-201ENST00000561202 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC111188.1-201ENST00000525758 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL031587.5-201ENST00000624344 1849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 RNASE8-201ENST00000308227 634 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 OR52L1-201ENST00000332249 1094 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 OR7E122P-201ENST00000383606 1017 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AP000346.2-202ENST00000425948 383 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PGAM5-202ENST00000454808 1084 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL359915.1-201ENST00000457719 898 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 FDPS-206ENST00000467076 1178 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL589666.1-201ENST00000503906 835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SCOC-209ENST00000512749 841 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AP003062.1-201ENST00000528497 762 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC027277.1-201ENST00000535363 533 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ADSSL1-208ENST00000555674 520 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TEX38-204ENST00000564373 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 DSCR9-203ENST00000581640 472 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MIR378I-201ENST00000582688 76 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC068675.1-201ENST00000588996 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC100788.1-201ENST00000591108 945 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC104521.1-201ENST00000598582 279 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC018695.2-201ENST00000602789 498 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC091736.1-201ENST00000609370 305 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 PDLIM2-218ENST00000614502 599 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC244097.1-201ENST00000621631 1216 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL139260.2-201ENST00000622355 2171 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL356583.1-201ENST00000398739 1371 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CCNB2-201ENST00000288207 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AL359878.1-201ENST00000381466 1886 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC004554.2-201ENST00000634846 1893 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 GZMH-201ENST00000216338 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 TMEM79-202ENST00000357501 975 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC007690.1-201ENST00000451924 468 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 RANBP6-202ENST00000485372 1000 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 HNRNPA1P7-201ENST00000521273 963 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AP001979.2-201ENST00000526254 975 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC027290.1-201ENST00000537827 484 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 SELENOK-205ENST00000541726 814 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GLI3P10071 AC090825.2-201ENST00000557959 739 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms