Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 UPK1A-203ENST00000616789 1366 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 FAM90A1-203ENST00000538603 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 NIPA1-207ENST00000561183 1675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 IKBKG-208ENST00000611176 1654 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 TCP11L1-209ENST00000531632 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC020917.4-201ENST00000623994 1999 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 WDR46-231ENST00000374617 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SPECC1-202ENST00000395522 2982 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 G0S2-201ENST00000367029 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AL391839.2-201ENST00000412085 383 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AL390778.2-201ENST00000420883 886 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 RPS23-204ENST00000507980 836 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC093300.1-201ENST00000510368 1201 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 LINC02369-202ENST00000540745 801 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 LINC02285-201ENST00000557121 943 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 JPT2-214ENST00000569765 782 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC010335.1-201ENST00000594590 599 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AL356740.1-201ENST00000602192 1297 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SERPINB6-206ENST00000380546 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 DLG2-205ENST00000398301 2070 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ABI2-213ENST00000424558 2240 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SLC1A7-202ENST00000371494 2637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SYBU-217ENST00000528331 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ZMIZ1-AS1-203ENST00000456353 2878 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 KIFC3-204ENST00000465878 3225 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SIN3B-202ENST00000379803 5129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 PHF2-203ENST00000610682 2921 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 BTN1A1-201ENST00000244513 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 GP6-201ENST00000310373 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CR383656.2-201ENST00000548656 2254 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CALCOCO1-218ENST00000550804 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CHMP5-202ENST00000419016 1957 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 PATL2-208ENST00000560780 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CD48-201ENST00000368045 1793 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SPDYA-202ENST00000379579 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 NIPSNAP3A-201ENST00000374767 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ASS1-203ENST00000372393 1548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 FAH-201ENST00000261755 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 MIR22HG-201ENST00000334146 1383 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 LAMA1-209ENST00000638611 1310 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
HHLA1C9JL84 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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