Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH8

ERVV-1, Endogenous retrovirus group V member 1 Env polyprotein, humanhuman

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Length 477 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-1B6SEH8 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC1A5-202ENST00000434726 1872 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GRIA3-208ENST00000620581 2991 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KRT8P38-201ENST00000441370 1430 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ERCC4-207ENST00000575156 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GSDMA-201ENST00000301659 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GZMB-201ENST00000216341 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DAD1-201ENST00000250498 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 INO80C-202ENST00000334598 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GH1-203ENST00000351388 685 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL513165.1-201ENST00000413915 289 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LINC02026-202ENST00000414309 772 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL662797.1-201ENST00000442852 799 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NDUFB2P1-201ENST00000506966 295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 UBE2D3-221ENST00000507845 577 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL161668.2-201ENST00000531638 492 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KCCAT198-201ENST00000549251 549 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC009041.1-201ENST00000565401 544 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC018846.1-201ENST00000568231 183 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KRT18P8-201ENST00000581937 1246 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC007193.3-201ENST00000598616 188 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CTSH-218ENST00000615999 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PAX6-237ENST00000638696 1203 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LINC00969-231ENST00000597482 1476 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DRD3-203ENST00000460779 1557 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SETMAR-205ENST00000425863 1657 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TRO-225ENST00000622017 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GFI1B-203ENST00000372123 1514 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 GP6-202ENST00000333884 2210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 TMBIM6-203ENST00000423828 3254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ZNF570-202ENST00000586475 1985 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 NKX2-1-AS1-201ENST00000521292 1775 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 PPIL3-205ENST00000409449 756 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SLC12A9-AS1-201ENST00000412754 369 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 SDCBP2P1-201ENST00000416115 614 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 CCND3P1-201ENST00000438347 580 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC022274.1-201ENST00000467082 490 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 HNRNPA3P6-201ENST00000472163 1006 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC023906.1-201ENST00000486386 453 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RPL29P2-202ENST00000498671 657 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC015795.2-201ENST00000512720 575 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 RNA5SP420-201ENST00000516997 137 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 LINC02376-201ENST00000536330 724 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC079414.2-201ENST00000567157 1104 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
ERVV-1B6SEH8 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
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