Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP64

ZCCHC17, Nucleolar protein of 40 kDa, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC17Q9NP64 MED11-201ENST00000293777 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 OTOS-201ENST00000319460 566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ID2-AS1-201ENST00000412712 953 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 EMP1-203ENST00000431267 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MIATNB-206ENST00000444388 918 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RPS23-207ENST00000511844 530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SBSN-202ENST00000518157 957 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC105219.2-201ENST00000527908 299 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AL162632.1-201ENST00000546784 548 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC027139.1-201ENST00000565286 951 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NMRK2-202ENST00000593949 869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NMRK2-204ENST00000599576 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SVOPL-203ENST00000421622 1653 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NPRL3-212ENST00000620134 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 DTD2-201ENST00000310850 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NFATC1-205ENST00000427363 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ZCCHC7-209ENST00000534928 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PGAM2-201ENST00000297283 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC253536.3-201ENST00000444093 558 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC011383.1-201ENST00000517474 617 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SERGEF-208ENST00000528200 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC011444.1-201ENST00000587836 639 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ASGR1-209ENST00000619926 1384 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC010255.3-203ENST00000509403 1727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CHRNA1-203ENST00000409219 1466 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 GPD1-205ENST00000548814 1591 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PDE4A-209ENST00000592685 2707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC087521.1-201ENST00000501541 2045 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC019109.1-201ENST00000401725 1874 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TMEM9-202ENST00000367332 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 GPER1-203ENST00000397092 2971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 NME6-208ENST00000435684 599 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 RPL3P5-201ENST00000441645 1232 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 APOC1-209ENST00000592885 562 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PLS3-210ENST00000626746 216 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ZCCHC17Q9NP64 SLC22A12-202ENST00000377567 2599 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67 ms