Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ENSA-208ENST00000369014 2085 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC005519.2-201ENST00000554532 1367 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINC00337-201ENST00000429480 1302 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 CD9-212ENST00000610354 1315 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PLA2G2A-201ENST00000375111 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PPP1R2P10-201ENST00000393023 595 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AL357079.1-203ENST00000412378 494 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PTPA-219ENST00000435305 530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC005042.2-201ENST00000449526 510 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AL157871.2-201ENST00000556212 552 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 TRPM1-210ENST00000559179 1002 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 C19orf53-202ENST00000588234 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 PCP2-202ENST00000598935 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 AC117500.5-201ENST00000623233 527 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 YWHAE-201ENST00000264335 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GAPVD1Q14C86 GOLGA8IP-202ENST00000611635 2100 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RECQL5-218ENST00000584999 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MRPS9-201ENST00000258455 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ZFYVE19-215ENST00000570108 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 TBC1D3P1-201ENST00000590047 1693 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 LAIR1-201ENST00000348231 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CDH16-204ENST00000565796 2694 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SAP18-208ENST00000621421 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 NANOS3-202ENST00000397555 769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 FAM126A-201ENST00000409763 616 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RPE-208ENST00000436630 1128 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 WASIR2-201ENST00000527434 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CCDC42-202ENST00000539522 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 NEMF-210ENST00000556672 590 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MIR4309-201ENST00000582498 83 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC010319.4-201ENST00000593957 691 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC006262.2-202ENST00000600152 333 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 LINC02427-202ENST00000605270 1059 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MIR6165-201ENST00000614803 84 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.141-201ENST00000615072 282 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PAX6-238ENST00000638755 1161 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 DDX46-212ENST00000628477 1584 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PGAM1P10-201ENST00000402426 761 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CLK2P1-201ENST00000416636 1294 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 IGHVII-33-1-201ENST00000524010 280 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SMCO4-202ENST00000525141 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC004923.1-201ENST00000527543 776 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 LINC02328-202ENST00000554647 522 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC104759.1-201ENST00000559109 939 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MIR4539-201ENST00000579784 60 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC015818.3-201ENST00000583797 589 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC136475.9-201ENST00000605240 497 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CSH2-207ENST00000613718 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 IMPDH1P5-201ENST00000439688 1540 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MIR100HG-219ENST00000533109 1794 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SKAP1-208ENST00000584924 1477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RUSC1-AS1-202ENST00000446880 1836 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CHIT1-202ENST00000367229 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 C19orf33-201ENST00000301246 467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 IDI2-AS1-204ENST00000437374 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 RPL13AP5-201ENST00000439189 612 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 HNRNPA1P72-201ENST00000529511 967 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC025219.1-201ENST00000559299 526 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 AC011479.1-202ENST00000591889 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 BCAS4-206ENST00000609336 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 DNAJB8-201ENST00000319153 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 PIN4-203ENST00000373669 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GAPVD1Q14C86 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
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