Protein–RNA interactions for Protein: Q02246

CNTN2, Contactin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN2Q02246 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 PLAT-211ENST00000524009 1613 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 RNF41-202ENST00000394013 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 HMGCLL1-203ENST00000370850 1171 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 PLAC9P1-201ENST00000397540 389 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 NAA60-205ENST00000424546 1149 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AL157392.3-204ENST00000440878 397 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 BX322557.2-201ENST00000445242 379 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 HMGB3-204ENST00000448905 812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SIX3-AS1-202ENST00000456467 557 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AC026191.1-204ENST00000517846 608 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CD44-224ENST00000526669 870 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 ABHD17AP9-201ENST00000561925 548 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AP000769.1-203ENST00000637245 208 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AL139424.3-202ENST00000641619 917 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 HSPA1L-201ENST00000375654 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AC016397.2-201ENST00000624848 1985 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 FKBP4P8-201ENST00000610931 1369 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CCNE2-201ENST00000308108 2724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SELENBP1-208ENST00000447402 1530 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 NEK3-210ENST00000620675 2072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 RIDA-201ENST00000254878 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 TMEM242-201ENST00000367144 1030 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 BANF1-205ENST00000527348 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 AL139339.2-201ENST00000608063 657 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 PSMA6-217ENST00000628955 364 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 SH3D21-205ENST00000505871 2205 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 EPM2A-218ENST00000639465 2203 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 BCL2L12-211ENST00000614495 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CNTN2Q02246 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms