Protein–RNA interactions for Protein: P82980

RBP5, Retinol-binding protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP5P82980 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 PDXDC2P-206ENST00000534700 1315 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 CRISP2-201ENST00000339139 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 CREB3L4-202ENST00000368600 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 FAM213A-203ENST00000372187 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 GPNMB-203ENST00000409458 1673 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 GOLGA8K-202ENST00000512626 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 GOLGA8T-202ENST00000569052 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 AL356753.1-201ENST00000427035 2018 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 AC111170.3-201ENST00000624282 2464 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 TMPRSS6-203ENST00000406725 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 AC109583.3-201ENST00000641183 3128 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 JMJD6-208ENST00000617192 5517 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBP5P82980 SREBF1-205ENST00000395757 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 SNX30-201ENST00000374232 7622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 PPM1M-201ENST00000296487 2429 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 MTSS1-216ENST00000524090 2166 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AC093462.1-201ENST00000621167 1683 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 FMO6P-201ENST00000236166 1620 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 ADAMTS10-201ENST00000270328 4194 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AC034228.2-201ENST00000432558 459 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AC069185.1-202ENST00000533405 471 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 ADAMTSL4-AS1-203ENST00000617352 1036 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 LRRFIP1-202ENST00000289175 3709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 TSPAN12-201ENST00000222747 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CAMK2D-204ENST00000394522 2696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 NADSYN1-216ENST00000530055 2416 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBP5P82980 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 TMEM40-205ENST00000435575 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 CACNA1A-211ENST00000592864 1623 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 NFE2L2-202ENST00000397063 2651 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 AP4M1-204ENST00000421755 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 SMG9-211ENST00000601170 2387 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 OR6A2-201ENST00000332601 1373 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBP5P82980 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.8 ms